阿拉善盟中心医院是1999年由原阿拉善盟医院和阿拉善左旗人民医院合并组建而成的一所集医疗、教学、科研、120急救、传染病防治和精神卫生为一体的盟市级综合医院，为包头医学院附属医院。2013年1月，被内蒙古自治区卫生厅准入为三级综合医院。
医院占地面积11.99万平方米，建筑面积3.4万平方米，绿化面积达6.95万平方米，开放床位343张。现有在职职工604人，其中卫生专业技术人员478人，占80%；高级职称162人，中级职称110人。研究生16人，本科学历301人，约占职工总数的50%。医院设有临床科室22个、医技科室8个、医辅科室5个、管理科室20个。2014年，医院门、急诊量204879人次，出院病人6967人次，开展手术1465台次。
医院拥有1.5T核磁共振、64排螺旋CT、数字减影血管造影机、全自动细菌培养和药敏分析仪、全自动生化仪和数字影像系统DR、数字胃肠X光机、电子腹腔镜、电子胃镜、彩超、碳-13检测仪等万元以上医疗设备250多台（套）。
医院历史可追溯至1946年阿拉善王府在定远营(即今巴彦浩特)设立的阿拉善地区首家官办西医机构——“阿拉善和硕特旗卫生所”。阿拉善和平解放及新中国成立后，在老卫生所基础上成立“人民医院”，后几经易名。1958年，更名为“阿拉善旗人民医院”，1961年随着阿拉善旗划分阿左、阿右旗，更名为“阿拉善左旗人民医院”。1980年，阿拉善盟成立。1981年，巴彦浩特新浩特门诊部成立。1983年在门诊部基础上成立“阿拉善盟医院”。1999年4月，经盟行署批准，“阿左旗人民医院”和“阿拉善盟医院”合并组建“阿拉善中心医院”，隶属阿左旗卫生局。2007年1月，阿拉善中心医院整体上划为盟级事业单位（随后更名为“阿拉善盟中心医院”），同年通过内蒙古自治区二级甲等综合医院等级评审。2008年7月6日，阿拉善盟中心医院综合大楼在新址举行开工奠基仪式，新医院建设拉开序幕。2011年11月，新建医院综合大楼正式投入使用。
医院紧紧围绕“一切以病人为中心”的服务宗旨，把坚持公立医院的公益性，社会效益放首位作为医院的根本宗旨和发展方向，把彻底解决群众就医难作为出发点和落脚点，持续改善就医条件，强化医疗质量管理，保证医疗质量安全，提高综合服务能力，努力为患者、社会提供优质服务。把不断提高临床医疗技术水平、完善医疗服务项目、加强科室建设和发展、打造重点专科与加强医院内涵建设和公立医院医药卫生体制改革有机结合起来。近年来，专科建设逐步向特色化、精细化方向发展，一批新技术、新业务快速发展，在盟内率先开展了心血管介入诊疗技术、心脏起搏器植入术、骨关节置换术、血液净化术等多项新技术、新业务，填补了阿盟医疗技术的多项空白。医院康复医学科集传统康复理疗与现代康复治疗为一体，发展迅速，正在积极申报自治区级重点学科。医院还拥有阿拉善盟地区唯一一家一站式健康体检中心。
科研工作的开展,是提高临床诊疗水平,推动学科发展,培育医院核心竞争力的保障。近年来，医院科研水平不断提高，参与完成了国家级科研项目CCS-2后，于2012年参加了国家心血管病中心阜外心血管病医院组织的“冠心病医疗结果评价和临床转化研究”项目。医院年均发表医学论文数十篇，荣获2010-2012年度全盟科技工作先进集体荣誉称号，有1人获得全盟科技人员突出贡献奖，“超声引导下穿刺活检的临床应用研究”项目获全盟科学技术进步一等奖、“短节段后路脊柱内固定方法的临床疗效研究”项目获得全盟科学技术进步二等奖，另有多项科研课题获得全盟科技进步三等奖，2014年在盟科委立项科研课题3项，进展顺利。卫生部科研课题《内蒙古阿拉善盟地区宫颈癌发病情况及细胞DNA定量分析技术应用于宫颈癌筛查的临床研究》目前亦正在顺利实施当中。
医院重视与区内外各大医院建立战略协作关系，是宁夏医科大学总医院、解放军第302医院、西安交大医学院第一附属医院协作医院，并与宁夏自治区人民医院、江苏省人民医院建立经常性的业务关系。与北京、上海地区建立了远程医学会诊平台，为患者提供远程诊疗服务；与西安金域医学检验中心建立了合作关系，拓展检验服务项目400余种。2013年与北京安贞医院建立对口支援关系。
随着公立医院改革的不断深入，医院的文化建设和职工思想道德教育基础更加坚实，逐步形成爱院如家、无私奋献、积极向上的良好风范。医院先后获得“全国三八红旗集体荣誉称号“、“全国五一巾帼标兵岗”、“全区卫生应急先进集体”等全国、自治区和盟级集体奖多项，有多人分别获得“全国卫生系统先进工作者”、“全区卫生系统先进工作者”等荣誉称号。
站在新的起点上，阿拉善盟中心医院将在十八大精神指引下，发扬“严谨、规范、诚信、奉献”的医院精神，牢记医者的社会职责与使命，继续奋发拼搏，积极进取，为不断提高人民群众健康水平继续努力，用实际行动迎来医院发展的新突破、新跨越、新腾飞。
